油菜与紫苏FAD3基因的序列比较分析

作者：柏云会; 张传利; 孙超; 杨加虎; 张玉松; 汪骞; 林良斌

来源：分子植物育种, 2021, 1-18.

• 甘蓝型油菜
• 紫苏
• FAD3
• α-亚麻酸

以甘蓝型油菜‘滇早油16号’ （亚麻酸（α-Linolenic acid， ALA）含量为9.7%）和‘紫苏滇紫1号’ （亚麻酸含量为64.7%）为材料，通过RT-PCR克隆开花后40 d种子的FAD3基因，分别获得了7条油菜和5条紫苏FAD3基因的CDS。油菜序列间存在着碱基缺失和碱基替换，其序列一致性为96.39%；紫苏序列间存在着碱基替换，无碱基缺失，其序列一致性为99.57%；但油菜和紫苏间的序列一致性仅为81.72%。油菜FAD3蛋白的等电点在7.42～7.85之间，偏中性，其氨基酸序列的一致性为为97%；紫苏FAD3蛋白的等电点为8.93偏碱性，其氨基酸序列的一致性为99.87%；但油菜和紫苏间的氨基酸序列一致性仅为83.33%。油菜FAD3蛋白和紫苏的均有3个跨膜区和3个组氨酸富集保守区。在组氨酸富集保守区有16个氨基酸改变，其中6个氨基酸发生性质改变。在第3组氨酸富集保守区和第3跨膜区，油菜的二级结构与紫苏的存在较大的差异。这些结果暗示了油菜FAD3酶的比活力和紫苏的可能不同，是引起其种子ALA含量不同的原因之一，为进一步提高油菜亚麻酸含量奠定理论基础。

• 单位
  云南农业大学; 云南省农业科学院园艺作物研究所