2012年-2013年云南边境禽流感病毒H5N1亚型血凝素基因分析

作者：刘庆亮; 张文东; 赵焕云; 胡挺松; 段博芳; 曾伟; 胡媛媛; 邱薇; 范泉水; 张应国; 宋建领; 张富强

来源：动物医学进展, 2014, 35(06): 96-102.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2014.06.002

• 禽流感病毒
• H5N1亚型
• 血凝素
• 分子特征

为了解2012年-2013年云南边境禽流感病毒H5N1亚型血凝素(HA)基因变异及进化特征,在云南边境采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品1 500份,经禽流感病毒H5N1亚型特异性多重RT-PCR检测,选择代表性阳性样品,进行病毒HA基因扩增、纯化、克隆和测序,并与已知毒株和参考毒株序列进行序列比对及系统遗传进化分析。结果自1 500份样品中检出H5N1亚型阳性样品60份,60份阳性样品病毒HA基因测序获得23种HA序列,可划分为2个不同进化分支(2.3.2,2.3.4),2.3.2进一步可划分为3个进化小分支(Ⅱ-1~Ⅱ-3),在23份代表性阳性样品中,17份样品属于进化小分支2.3.2Ⅱ-1,3份属于2.3.2Ⅱ-2,其余3份属于2.3.4;阳性样品中病毒HA裂解位点序列均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征,HA受体结合位点、糖基化位点、表位关键性氨基酸位点及其他氨基酸位点存在变异,部分位点的变异具有分支或亚(小)分支特异性。2012年-2013年期间云南边境禽流感病毒H5N1亚型间具有遗传差异,进化分支2.3.2Ⅱ-1成为当地流行的优势毒株。

• 单位
  云南省动物疫病预防控制中心; 云南农业大学