目前,航道工程已经由粗放式向生态化、多元化发展,以满足人民对美好生态环境的需求。国内对于生态航道已经有了许多明确的定义,但从统筹规划上来看,航道的生态化发展应从系统层面上考虑。从系统层面来分析生态航道的发展方向,根据当前研究进展分析了生态航道发展悖论,提出了生态航道系统的概念并分析其内涵;介绍了可用于生态航道系统评价的两种方法:生态足迹法与灰色关联法,并针对生态航道系统做出适配,分析了这两种评价方法的特点及应用,并给出了生态航道系统的若干整治措施。