本发明涉及一种酶法酯交换方法,包括以下步骤:在脂肪酶的作用下,甘油三酯A与甘油三酯B进行酯交换反应;所述甘油三酯A为短链甘油三酯、中链甘油三酯和长链甘油三酯中的至少一种;所述甘油三酯B为长链甘油三酯;所述脂肪酶为脂肪酶MAS1或MAS1-H108A。本发明方法可以同时高收率地实现短/中/长甘油三酯与长链甘油三酯的酯交换。