高致病性PRRSV SC-JX01株Nsp2基因的序列分析和抗原表位预测

作者：郭杨; 林华; 郭宇飞; 郭万柱

来源：中国兽医杂志, 2010, (04): 10-13.

• 高致病性PRRSV
• Nsp2基因
• 序列分析 highly pathogenic PRRSV
• Nsp2 gene
• sequence analysis

将扩增SC-JX01株得到的Nsp2基因cDNA片段克隆于pMD-T载体中。提取pMD-Nsp2质粒,测序后利用DNAStar软件进行序列分析。结果表明,SC-JX01株Nsp2基因与GenBank已发表的高致病性PRRSV Nsp2基因序列的相似性为98.1%~99.1%,氨基酸的相似性为95.9%~98.0%,具有相同的30个氨基酸缺失。本研究表明,SC-JX01株Nsp2基因与分离自不同地区高热病毒株的Nsp2基因序列具有相同的缺失。由于SC-JX01株的Nsp2基因存在氨基酸的缺失,与VR2332株比较,其亲水性、抗原指数均发生了大的变化。

• 单位
  四川出入境检验检疫局; 金陵科技学院; 四川农业大学