25株SIV/HIV的进化分析及意义

作者：袁伟; 吴宏宇; 黄青山

来源：复旦学报(自然科学版), 2006, (03): 303-308+315.

DOI：10.15943/j.cnki.fdxb-jns.2006.03.006

• SIV
• HIV
• 进化分析
• Neighbor-Joining方法
• Maximum Likelihood方法 SIV
• phylogenetic analysis
• Neighbor-Joining method
• Maximum Likelihood method

选取了16株SIV和9株HIV毒株,以人T细胞白血病病毒HTLV-1为outgroup,使用CLUSTAL X、PHYLIP及MEGA三种软件对它们的基因组序列及三个主要蛋白(Env,Gag,Pol)序列分别进行了比对分析,用Neighbor-Joining(N-J)方法和Maximum Likelihood(ML)方法分别构建出进化树.结果显示HIV起源于SIV,其中HIV-1的起源与SIVcpz的几种亚型高度相关,HIV-2的起源与SIVsm及SIVmm高度相关.

• 单位
  遗传工程国家重点实验室; 生命科学学院; 复旦大学; 上海高科联合生物技术研发有限公司