谷子SBP转录因子家族基因的表达分析

作者：杜晓芬; 韩康妮; 李禹欣; 王智兰; 连世超; 王军^*

来源：山西农业科学, 2021, 49(12): 1474-1482.

• 谷子
• SBP转录因子
• 表达分析
• 生物信息学分析
• 荧光实时定量分析

SBP(Squamosa promoter binding protein)是植物中一类特有的转录因子,在调控株型建成、开花、产量、激素信号转导、逆境响应等方面发挥重要作用。为探究谷子SBP家族基因的表达模式,利用生物信息学和荧光实时定量PCR,对19个SiSBPs在不同组织器官中的表达模式进行了分析,并对其启动子顺式作用元件进行预测,进一步分析了7个SiSBPs对3种植物激素和3种逆境胁迫的响应规律;同时,利用ps RNATarget server对miR156和miR529的靶基因结合位点进行了预测。结果表明,SiSBP17总体表达水平低于其他基因,SiSBP19表现为组成型表达,其余SiSBPs表现出明显的组织表达特异性;7个SiSBPs对生长素、赤霉素、茉莉酸甲酯等外源植物激素和ABA、冷、干旱等胁迫处理均有响应,不同基因在不同激素和逆境胁迫下的响应规律存在差异;另外,研究预测到13个SiSBPs存在miR156和miR529结合位点。

• 单位
  山西农业大学