湖北株H3N8亚型马流感病毒HA基因的序列测定及其HA蛋白遗传特性分析

作者：黄文强; 郭巍; 赵立平; 盛名巍; 王宇; 李红梅; 相文华

来源：中国兽医学报, 2010, (05): 612-614+656.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2010.05.017

• H3N8亚型马流感病毒
• HA基因
• 马流感疫苗 H3N8 subtype equine influenza virus
• HA gene
• equine influenza vaccine

2008年从湖北省分离到1株H3N8亚型马流感病毒A/equine/Hubei/6/08。以2002年美国KENTUKY株为模板设计HA基因测序引物,进行RT-PCR,然后测定该分离株的HA基因核苷酸序列。经NCBI上Blast同源性比较发现,与A/equine/Newmarket/5/2003(H3N8)同源性较高为98.7%。HA蛋白遗传进化分析表明该毒株隶属于H3N8亚型马流感病毒中的美洲系福罗里达亚系。该株与OIE现在推荐的疫苗候选株A/equine/Kentuck-y/5/2002(H3N8)HA1蛋白氨基酸序列比对发现有3处氨基酸替换位点;与OIE以往推荐的疫苗候选株A/e-qui...

• 单位
  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所; 兽医生物技术国家重点实验室