基于TCGA数据库构建和验证肝癌的溶酶体相关预后模型

作者：陈君; 张宁^*

来源：中国临床药理学杂志, 2023, 39(24): 3656-3659.

DOI：10.13699/j.cnki.1001-6821.2023.24.024

• 肝细胞癌
• 溶酶体相关基因
• 癌基因组图谱
• 国际癌症基因组联盟
• 预后模型

目的 构建溶酶体相关基因的肝细胞癌预后预测模型并验证。方法 从癌基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库下载肝癌RNA-seq数据及临床数据。从Misdgb网站下载了121个溶酶体相关基因。使用差异分析和单因素比例风险模型(COX)回归分析在TCGA中筛选出与肝癌患者总生存期有关的差异表达的溶酶体相关基因(P<0.05)。利用最小绝对收缩和选择算子(Lasso)和COX回归分析构建预后预测模型。然后使用生存分析评估该模型，在ICGC中验证。并对该预后模型进行独立预后分析。结果 构建了由11个溶酶体相关基因构成的预后预测模型。生存分析显示，高风险组的生存率明显低于低风险组，差异有统计学意义(P<0.05)。独立预后分析显示，该风险评分和肿瘤分期可作为预测肝癌的独立预后因素(P<0.05)。结论 本研究构建了11个溶酶体相关基因的预后预测模型，且风险评分可作为肝癌患者的独立预后因素。

• 单位
  复旦大学附属金山医院