RNA G-四联体结构区的同义密码子进化选择（英文）

作者：许育铭; 齐婷; 顾万君; 陆祖宏^*

来源：Journal of Southeast University (english Edition), 2021, 37(02): 177-183.

• RNA结构
• G-四联体
• 同义密码子
• 进化
• 选择

为探索同义密码子对RNA G-四联体(rG4)形成的适应效应,利用G4Hunter算法搜寻5类真核生物mRNA蛋白编码区的rG4结构.通过对比天然序列和随机序列,评估rG4结构对同义密码子的选择偏好,分析影响rG4形成的因素,检验基因特定区域rG4结构的选择压力,以揭示rG4在基因调控中的潜在作用.结果表明,在5类真核生物中,rG4结构区内的同义密码子普遍受到促使rG4形成的选择压力.在rG4结构区内的蛋白编码序列倾向于使用富含鸟嘌呤的密码子组合,不倾向于选择富含胞嘧啶的密码子组合.密码子使用偏好、碱基成分以及进化速率等因素和rG4对同义密码子的选择压力具有相关性.基因翻译起始区的序列受到更强的促使rG4结构形成的选择压力.

• 单位
  东南大学生物科学与医学工程学院; 生物电子学国家重点实验室; 东南大学