反硝化细菌Y39-6的基因组及生理生化特征研究

作者：韩国秀; 张多英; 张彦龙^*; 张军^*; 曾伟民; 赵丹丹; 雷虹

来源：黑龙江大学自然科学学报, 2023, 40(03): 300-308.

DOI：10.13482/j.issn1001-7011.2021.06.139

• 反硝化细菌
• 假单胞菌
• 基因组
• 比较基因组
• 脂肪酸

菌株Y39-6是从哈尔滨周边地区地下水中分离的一株假单胞菌，具有异养反硝化和自养脱氮能力，由于假单胞菌属内的菌种鉴定存在复杂性，对菌株Y39-6的具体分类仍有争议。通过获得菌株Y39-6的全基因组序列，进行比较基因组学分析，分析了菌株的碳源利用和脂肪酸含量特征，对菌株的生理生化特征进行了系统研究。发现菌株Y39-6与模式菌Pseudomonas veronii CIP 104663T的基因组相似性更高，G+C的含量接近，共有基因数量最多，为368个，碳源利用特征相似，可以确定菌株Y39-6属于Pseudomonas veronii菌种。菌株Y39-6有15个特有基因，主要脂肪酸为C16∶0和C17∶0 cyclo,含量分别为22.05%和21.25%,与Pseudomonas veronii菌种的其他菌株相比，存在明显的特异性。通过以上研究，确定了菌株Y39-6的分类地位和生物学特征，为菌株Y39-6的进一步应用提供了生物学参考依据。

• 单位
  生命科学学院; 建筑工程学院; 黑龙江大学