小豆AP2/ERF基因家族鉴定及其应答锈菌侵染的表达分析

作者：柯希望; 张金鹏; 刘国辉; 殷丽华; 张盼盼; 曹鸣宇; 康静; 杨阳; 徐晓丹; 郭永霞; 左豫虎^*

来源：植物病理学报, 2020, 50(04): 394-412.

DOI：10.13926/j.cnki.apps.000462

• 小豆
• 小豆锈病
• 豇豆单胞锈菌
• 转录因子

为明确小豆VaAP2/ERF家族基因在小豆应答豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)侵染中的作用,本研究采用生物信息学方法从小豆基因组中鉴定VaAP2/ERFs家族基因186个,包括AP2(24个)、RAV(2个)、Soloist(1个)及ERF(159个)四个亚家族,其中ERF亚家族又可分为DREB和ERF两个亚类。基因结构分析发现,68.3%的VaAP2/ERFs基因不具内含子。保守基序分析发现,各亚族成员保守域组成类似,可作为基因家族分类的重要依据。前期转录组测序发现VaAP2/ERF中的6个成员接种后24 h显著上调,进一步应用qPCR技术对其在‘1-D-3’(免疫)及‘宝清红’(感病)中应答锈菌侵染的表达分析发现,免疫品种中6个成员均于接种后6 h及120 h显著上调,另有2个于接种后12 h也显著上调,表明上述基因均在小豆抗锈病中发挥正调控作用。

• 单位
  榆林学院; 生命科学学院; 黑龙江八一农垦大学