摘要
目的 探讨微小RNA(miRNA)-139-5p在肝癌组织中的表达及其对人肝癌细胞增殖、侵袭的影响和潜在的分子机制。方法 采用生物信息学方法,从GEO数据库中下载GSE36915数据集,进行差异miRNA分析,结合TCGA-LICH数据集中的生存数据,筛选与预后显著相关的miRNA。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测miR-139-5p在肝癌及其癌旁组织中的表达。利用CCK-8实验、Transwell实验观察miR-139-5p对人肝癌细胞SK-Hep-1和SMMC-7721的表型变化。采用高通量测序检测过表达miR-139-5p的SK-Hep-1细胞中基因表达的变化,确定miR-139-5p调控的潜在的信号通路和靶基因,并采用免疫印迹实验和报告基因实验进行验证。结果 通过对GSE36915数据集进行分析,共鉴定到50个显著差异表达的miRNA。结合TCGA-LICH数据集中的生存数据,发现在差异最显著的20个miRNA中,miR-15b-3p、miR-1180-3p、miR-139-5p、miR-139-3p与预后显著相关,最终确定miR-139-5p为进一步研究对象。miR-139-5p在100对肝癌组织的相对表达水平显著低于对应癌旁组织[(0.50±0.33) vs (1.02±0.43),P<0.001],且低水平的miR-139-5p肝癌患者中位生存期较短(25.5个月vs 43.0个月,P<0.01)。人肝癌细胞系SK-Hep-1和SMMC-7721中过表达miR-139-5p,可以显著抑制肝癌细胞的增殖和侵袭。高通量测序分析发现,在过表达miR-139-5p的SK-Hep-1细胞中,差异表达基因显著富集在Sphingolipid信号通路。经免疫印迹实验和报告基因实验验证,Sphingolipid信号通路中神经酰胺合成酶6(ceramide synthase 6,CerS6)是miR-139-5p的新的靶点。结论 miR-139-5p在肝癌组织中表达减少,导致其下游靶基因CerS6过量表达,从而激活Sphingolipid信号通路,促进肝癌发生发展。本研究提示miR-139-5p可以作为肝癌治疗的新的靶点。
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