家兔基因组选择准确性评估

作者：陈仕毅; 贾先波; 赖松家^*

来源：中国养兔杂志, 2022, (01): 8-11.

• 最佳线性无偏估计
• 基因组最佳线性无偏估计
• 家兔育种

基因组选择是目前最先进的畜禽育种技术，但在家兔上还未见相关报道。本研究模拟了一个家兔选育群体，设计4个微效多基因控制性状（其遗传力分别为0.05、0.10、0.25和0.40），共开展8个世代的人工选育试验。在选育群的第6和第7世代，随机选择500、1 000、1 500或2 000只个体组建用于训练遗传评估模型的训练集，在第8世代中随机选择500只个体作为验证集，训练集和验证集中的所有个体进行50 K SNP分型；在此基础上，比较分析了基于系谱信息的传统最佳线性无偏估计（PBLUP）、基于基因组信息的基因组最佳线性无偏估计（GBLUP）、和基于系谱和基因组信息的单步基因组最佳线性无偏估计（ssGBLUP）3种遗传评估模型在育种值估计上的准确性。结果发现，当训练集样本数达到1 500只时，GBLUP方法在所有遗传力情况下均优于传统的PBLUP方法，能提高约30%的准确性。当使用ssGBLUP方法时，即使在遗传力为0.05和训练集大小为500只的情况下，与PBLUP方法相比其估计准确性也具有明显地提高；随着训练集大小的增加，ssGBLUP方法估计准确性具有显著地提高，增幅可以达到1倍。因此，认为在家兔上实施基因组选择具有很强的可行性，在前期阶段可以对小规模样本进行基因分型，然后使用ssGBLUP遗传评估模型进行育种值估计。

• 单位
  动物科技学院; 四川农业大学