亚洲地区丙型肝炎病毒基因重组研究

作者：张克英; 周林源; 杨晓江; 张鸿雁; 迟坤; 张统一; 尹敏红; 邵中军

来源：兰州大学学报(医学版), 2014, 40(04): 13-17.

DOI：10.13885/j.issn.1000-2812.2014.04.003

• 丙型肝炎病毒
• 基因
• 重组

目的检测亚洲地区丙型肝炎病毒(HCV)基因重组事件,探讨其重组规律及重组病毒株的分布情况。方法收集Gen Bank中HCV病毒基因全序列1 192条,标记病毒分离地点并选出亚洲地区HCV序列296条,利用MEGA4.1软件对齐整理,参照参考序列去除空位。利用最大似然法构建进化树,划分HCV基因型,统计出亚洲地区HCV不同基因型的分布特征。运用RDP4.0软件检测HCV中的重组事件,统计基因型内与基因型间重组事件的发生规律。结果 1型为亚洲地区流行的主要基因型,共检测到重组序列22条。结论不同基因型HCV在亚洲各地区分布有差异。基因重组断点在HCV基因组中散在分布,可能影响HCV病毒学特性与临床特征。

• 单位
  中国人民解放军61886部队; 第四军医大学; 兰州大学第二医院; 中国人民解放军南京陆军指挥学院