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摘要
全基因组范围内挖掘并鉴定油棕脂肪酶基因(GDSL)家族成员，并对其进行生物信息学及表达分析，为今后油棕GDSL的功能研究奠定基础。以拟南芥GDSL蛋白序列为标签，在油棕全基因组数据库中BLAST同源GDSL蛋白序列，并通过CDD和PFAM数据库完成GDSL蛋白序列的分析，剔除无保守结构的序列，最后利用生物信息学对油棕GDSL家族成员进行可视化分析。共获得109个油棕GDSL基因，其中有90个基因分布在油棕的15条染色体上，1号染色体上含有的基因数最多，为14个；基因结构较为稳定，大多数基因具有5个外显子，少数基因的外显子数目变化较大；油棕GDSL基因家族motif保守性较高；通过预测蛋白的二级结构，发现EgGDSL蛋白均存在α-螺旋、β-转角、无规卷曲及延伸链这4种结构，其中75个EgGDSL以无规卷曲为主要结构，α-螺旋为次要结构，34个蛋白以α-螺旋为主要结构，无规卷曲为次要结构；通过热图分析发现EgGDSL基因在油棕不同组织中（中果皮， 果仁， 根， 叶， 茎和花）均有一定的表达，且具有显著的组织和时空表达特异性。本研究首次提供了油棕GDSL基因家族的染色体定位、基因结构、保守motif、氨基酸理化性质、系统进化树及基因在不同组织中的表达信息，为今后深入研究其在油棕生长发育、脂质代谢等过程的作用机理提供理论依据。
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单位海南省热带油料作物生物学重点实验室; 中国热带农业科学院椰子研究所
