不同纤维源日粮下东北梅花鹿瘤胃微生物功能基因的宏基因组分析

作者：张辉^*; 丛立新; 魏园; 赵晨旭; 刘国文

来源：中国兽医学报, 2020, 40(07): 1391-1396.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.07.22

• 东北梅花鹿
• 瘤胃微生物
• 玉米秸叶
• 柞树叶
• 功能基因

为了研究不同粗纤维源日粮对梅花鹿瘤胃微生物区系的影响,选择10头健康公鹿分成JG、ZS 2组,每组5头,分别以玉米秸叶和柞树叶作为粗纤维源,试验时期为2个月,提取梅花鹿瘤胃液中微生物总基因,构建文库并测序及基因功能注释分析。结果表明:JG和ZS 2组样本的总碱基数量和总序列数量分别为11150909160和12540742633、75018396和84518090。在JG和ZS 2组样品中约1/2以上的纤维素糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)来自于瘤胃球菌属(Ruminococcus)(JG和ZS 2组样品分别为52.79%和51.07%)和纤维杆菌属(Fibrobacter)(JG和ZS 2组样品分别为14.22%和15.49%)。而很大一部分半纤维素酶由Ruminococcus(分别为39.20和37.55%)、普雷沃菌属(Prevotella)(分别为22.68%和20.66%)、Fibrobacter(8.86%,9.48%)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium)(2.27%,1.94%)分泌。此外,共有24个GHs家族参与植物细胞壁多糖的降解,其中GH5、GH9、GH45和GH48为降解纤维素的优势酶类,GH8、GH10、GH11、GH26、GH28、GH51、GH53、GH78对于半纤维素降解起重要作用,而对于寡糖降解起主要作用的有GH1、GH2、GH3、GH43和GH94。结论:当饲喂粗纤维较多玉米叶时,以降解纤维素为主的纤维降解酶的比例升高,而寡糖降解酶在瘤胃中的比例降低;当饲喂含丰富可发酵碳水化合物的柞树叶时,结果相反。

• 单位
  动物科技学院; 吉林农业科技学院; 吉林农业大学; 吉林大学