基于生物信息学的致病菌特有基因预测及分析

作者：牛超; 王月兰; 岳俊杰; 程义勇; 高志贤; 梁龙

来源：生物技术通讯, 2010, (04): 523-526.

• 致病菌特有基因
• 毒力因子
• 毒力
• 预测 pathogen-specific genes
• virulence factor
• virulence
• prediction

目的:利用生物信息学方法对致病菌特有基因进行大规模预测,同时探讨致病菌特有基因与致病菌毒力之间的关系。方法:构建致病性细菌蛋白质序列数据库和非致病性细菌蛋白质序列数据库,利用同源性比对的方法(BlastP工具)对致病菌特有基因进行预测;同时从文献中提取与致病菌毒力紧密相关的毒力因子,构建具有代表性的毒力因子分析库,对预测的致病菌特有基因进行比较分析。结果:在致病菌780310个基因中,预测了致病菌特有基因79166个,约占致病菌总基因的10.15%;预测的致病菌特有基因包含了构建的毒力因子分析库中的大部分毒力基因。结论:预测的致病菌特有基因与致病菌毒力紧密相关,大大减少了进一步在致病菌基因组中...

• 单位
  病原微生物生物安全国家重点实验室; 军事医学科学院