2009～2011年河北省卢龙地区G9P[8]型人A组轮状病毒全基因组序列分析

作者：马鑫; 李丹地; 郭延青; 向静瑶; 李秀萍; 段招军

来源：病毒学报, 2014, 30(02): 119-127.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002452

• 轮状病毒
• 全基因组
• G9P[8]
• 变异

了解20092011年河北省卢龙地区婴幼儿腹泻样本中A组轮状病毒(Group A rotavirus,GARV)G9P[8]型毒株的基因特征。随机选取2009年至2011年5株G9P[8]型卢龙GARV,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)的方法对GARV进行11个片段基因扩增,并对全基因序列通过DNAStar、MEGA等生物软件进行比对、同源性分析及系统进化分析。其中2011年的2株标本LL11131077和LL11131083之间的同源性明显高于它们与2009年和2010年3个毒株的同源性。20092011年河北卢龙地区流行的G9P[8]型GARV与世界其他地区流行的G9P[8]型GARV毒株均属同一基因型,但是2011年的2个毒株与2009年和2010年相比部分基因片段系统进化树不在一个亚枝内,同时也发生了多位点的氨基酸变异。

• 单位
  宁夏医科大学; 兰州大学; 第一临床医学院; 宁夏医科大学总医院; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所