皱皮香猪3个基因组拷贝数变异的多态性分布

作者：王州; 冉雪琴^*; 牛熙; 李升; 黄世会; 王嘉福^*

来源：中国畜牧杂志, 2019, 55(06): 31-38.

DOI：10.19556/j.0258-7033.2019-06-031

• 皱皮香猪
• 拷贝数变异
• 多态性
• 皮肤
• 剂量效应

为探究皱皮香猪个体产生皮肤变异的根本原因,本文基于重测序数据,采用生物信息学分析皱皮香猪基因组中的拷贝数变异(CNV),通过荧光定量PCR方法检测皱皮香猪中3个CNVs的拷贝数变异规律,并与香猪和大白猪进行比较。结果表明:3个CNVs在猪群中的拷贝数变异呈现出多态性变化,皱皮香猪中CNV1以拷贝数缺失型为主,其中的MPC1和RSK3基因可能与脂肪沉积有关;皱皮香猪CNV2和CNV3以拷贝数增加型占优势,其中的CCL17和CX3CL1基因参与皮肤等组织的炎症反应,可能通过剂量效应引起香猪皮肤产生褶皱。

• 单位
  贵州大学; 铜仁学院; 动物科学学院