科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的 采用16S rDNA V3-V4区高通量测序，并结合特异基因的PCR检测，研究新疆维吾尔自治区喀什地区亚洲璃眼蜱体内菌群特征及常见病原菌携带情况，为当地蜱传疾病防控提供理论依据。方法 于2021年5月在喀什地区巴楚县采用布旗法采集游离蜱342只，经形态学和特异性16S rDNA检测鉴定蜱种；除228只用于分离培养外，其余114只提取全基因组DNA,采用Illumina Novaseq测序平台进行16S rDNA V3-V4区高通量测序，分析喀什地区亚洲璃眼蜱携带菌的种类及其相对丰度水平；根据新疆地区既往报道常见蜱媒病原菌分布情况及蜱种带菌特征，选取6种常见病原菌对其特异性基因进行PCR检测，分析各病原菌的携带情况，并与高通量测序结果进行比较分析。结果 16S rDNA V3-V4区高通量测序分析显示1个样本携带贝纳柯克斯体；所有样本在属水平均检出立克次体属，16个样本检出无形体属，但缺少种水平注释；所有样本均未检出疏螺旋体。PCR法检测表明14只蜱携带伯氏疏螺旋体，7只蜱携带米氏疏螺旋体，3只蜱携带嗜吞噬细胞无形体，2只蜱携带贝纳柯克斯体，斑点热立克次体及查菲埃立克体未检出。结论 与特异基因的PCR法相比，16S rDNA V3-V4区高通量测序能够同时检测多种病原体，但也存在其检测受限于数据库、无法检测到种水平等缺点。因此，在病原监测的实际应用中，两种方法应相互结合，才能更全面、准确的反应当地蜱媒病原菌的分布情况。
- 单位
