小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析

作者：徐武; 刘建丰; 张戈; 徐文; 袁祖丽^*

来源：河南农业科学, 2019, 48(11): 7-17.

DOI：10.15933/j.cnki.1004-3268.2019.11.002

• 小麦
• 几丁质酶基因家族
• 全基因组鉴定
• 禾谷镰刀菌
• 表达模式

对小麦几丁质酶基因家族成员进行鉴定,并对其基因结构、保守基序、染色体分布、系统进化及禾谷镰刀菌胁迫下的表达水平进行分析,为进一步研究几丁质酶基因在小麦应答各种生物胁迫中的作用和在抗病分子育种中的应用奠定基础。结果表明,从小麦基因组中共鉴定到159个几丁质酶基因,分布在21条染色体上;小麦几丁质酶基因家族成员分为5类,隶属于GH-18和GH-19两个亚家族。GH-18亚家族包括Ⅲ、Ⅴ类,分别含有34、48个基因;GH-19亚家族包括Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ类,分别包含52、13、12个基因。同一亚家族的成员聚类在同一分支上,并且具有相似的外显子-内含子基因结构和保守基序。在被禾谷镰刀菌侵染后,4个小麦品系中几丁质酶基因家族一些成员的表达均显著上调。

• 单位
  河南省农业科学院; 河南农业大学; 河南省农业科学院农业经济与信息研究所; 生命科学学院