基于下呼吸道标本靶向宏基因组测序技术评估西藏高原地区社区获得性肺炎的病原学分布特征

作者：小巴桑; 张艳艳; 史丹丹; 白玛央金; 史兴亚; 张云桃; 贺航咏^*

来源：西藏科技, 2022, (10): 42-48.

• 靶向宏基因组测序技术(tNGS)
• 西藏高原地区
• 社区获得性肺炎(CAP)
• 病原学

目的 该研究拟应用下呼吸道标本靶向宏基因组测序技术（tNGS）评估西藏高原地区社区获得性肺炎（CAP）的病原学分布特点。方法 该研究为单中心前瞻性队列研究。纳入西藏自治区拉萨市人民医院呼吸与危重症医学科2021年11月至2022年5月收入院的200例CAP患者，均留取支气管肺泡灌洗液（BALF）或深部痰标本行tNGS检测。评价CAP患者细菌、非典型病原体和病毒等不同病原学的阳性检出率和分布特点。结果共测定下呼吸道tNGS样本总数200例，其中BALF标本161例，痰标本39例。球菌中检出率最高的为肺炎链球菌11.5%(21/200)，杆菌中检出率最高的为嗜血杆菌属细菌58例（29%），真菌中检出最多为白色念珠菌46例（23%），且在BALF标本中的检出率显著低于痰标本（15.53%v.s.53.85%,p<0.001）；其他病原体中最常见为结核分支杆菌24例（12%）；其次为肺炎支原体4例（2%），且在BALF中的检出率显著高于痰标本检出率（2.48%比0.00%,p<0.05）。在常见呼吸道病毒中，鼻病毒检出率最高，共30例（15%），其中以A型鼻病毒为主（16例，8%）。结核分枝杆菌检出率在COPD组最高，显著高于支气管扩张组和其他非慢性气道疾病组（55.17%、0.00%、4.46%,p<0.001）；铜绿假单胞菌在三组患者检出率无显著性差异。结论 西藏高原地区CAP感染病原体分布存在多样性且有自身地域特点，其中以肺炎链球菌、嗜血杆菌属、白色念珠菌和鼻病毒在各类型病原体中检出率最高。结核分枝杆菌检出率在COPD组最高。

• 单位
  首都医科大学附属北京朝阳医院