基于线粒体基因标记的太平洋褶柔鱼群体遗传结构及变异分析

作者：张琴; 曹洋铭; 陆化杰; 刘洋; 张忠; 方舟; 王丛丛^*

来源：上海海洋大学学报, 2021, 30(04): 763-769.

• 太平洋褶柔鱼
• 遗传变异
• 细胞色素C氧化酶Ⅰ
• 细胞色素b

为科学管理和开发利用太平洋褶柔鱼(Todarodes pacificus)渔业资源,利用线粒体DNA(mtDNA)细胞色素C氧化酶Ⅰ(COⅠ)和细胞色素b(Cytb)2种标记基因对西北太平洋褶柔鱼进行群体遗传结构和变异分析。结果显示:太平洋褶柔鱼2种基因片段的序列长度分别为465 bp(COⅠ)和404 bp(Cytb),分别定义18和21个单倍型,总体呈现低单倍型多样性(h=0.493 0、0.479 0)和低核苷酸多样性(π=0.001 3、0.001 4);遗传分化系数(Fst)均为负值,而分子生物学方差分析结果表明该群体变异都来源于种内;太平洋褶柔鱼COⅠ基因序列的Tajima’s D和Fu’s Fs的中性检验D值和Fs值显著偏离0,且二者显著性检验P<0.01,与Cytb基因标记的群体结果相似。综上,位于东海和日本海海域的太平洋褶柔鱼种群遗传多样性较低,群体间基因交流频繁未出现遗传分化,且变异基本来源于种内,群体大约在1.2万～1.5万年前出现过种群扩张。建议将太平洋褶柔鱼划分为一个管理单元,以便该渔业资源更加合理地保护与开发利用。

• 单位
  上海海洋大学