本文从目前高校财政专项资金绩效评价系统存在的问题入手,从相关人员重视程度欠缺、专项资金绩效评价体系未完善、制度未结合高校实际制定和绩效评价结果利用不足等多个方面分析问题产生的原因,针对具体问题进行深入研究并提出相应的合理性建议,使绩效评价对预设目标的实现起到更加积极的促进和激励作用,能够为今后的工作提供新的思路和依据,更好地保障财政专项资金绩效评价工作的有效开展,提高财政专项资金的应用效果。