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摘要
用262个SSR标记对来自不同生态区的540份水稻品种的基因组变异进行扫描,分析该自然群体的遗传多样性、群体结构和连锁不平衡位点,并采用TASSEL软件的一般线性模型(GLM)方法进行标记与性状的关联分析。结果表明:1)该自然群体由7个亚群体组成;每个亚群内,无论是共线SSR标记位点之间还是非共线SSR标记位点之间均存在一定程度的连锁不平衡。2)三年均检测到的与粒长显著相关的标记位点有45个,贡献率最高的是RM5849(52.86%),M3766-140是增加表型效应最大的等位变异,载体品种是农香25。与粒宽显著相关的位点有7个,贡献率最高的是RM17(63.61%),增加表型效应最大的等位变异是RM17-145和RM573-235,载体品种分别是宁粳恢338和早十日黄稻。与粒厚显著相关的位点有11个,贡献率最高的是RM276(25.44%),增加表型效应最大的等位变异是RM508-215和RM7288-205,载体品种都是红芒沙粳。与千粒重显著相关的位点有6个,贡献率最高的是RM17(32.17%),增加表型效应最大的等位变异是RM17-145,载体品种是宁粳恢338。预测了利用这些载体材料改良籽粒性状的潜在杂交亲本组合。
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单位南京农业大学; 作物遗传与种质创新国家重点实验室
