应用宏基因组学鉴定国内第一株鸭2型腺病毒

作者：陈峰; 招丽婵; 覃健萍; 周庆丰; 罗玉子; 林丽苗; 操胜; 李海燕

来源：中国预防兽医学报, 2015, 37(12): 903-907.

• 宏基因组
• 鸭2型腺病毒
• 分离鉴定

为分离鉴定广东某养鸭场疑似"肝坏死"病例的病原,本研究将采集的病料样品感染番鸭胚及番鸭胚成纤维细胞(MDEF)进行病原分离,提取出现细胞病变培养物的核酸,采用宏基因组学方法,以随机引物反转录并合成双链DNA进行PCR扩增,扩增产物进行分子克隆和测序分析。结果显示:F6代分离的病毒滴度为log105.0TCID50/m L,能够导致9日龄11日龄番鸭胚死亡及MDEF产生明显细胞病变。50个随机克隆经Gen Bank检索有28个为鸭2型腺病毒(DAd V-2)同源序列,核苷酸同源性为92%99%。28个同源序列形成8个毗连序列群,共计15 107 bp,覆盖DAd V-2基因组全长的34.54%,分离株与Gen Bank中唯一的DAd V-2 GR分离株亲缘关系最近,其部分hexon基因编码的氨基酸同源性为83.3%。参照测定序列设计的引物能够特异性扩增病毒基因。本研究首次应用宏基因组学分离获得国内首株DAd V-2,也是迄今除了法国以外国内首次报道的DAd V-2分离株。

• 单位
  中国农业科学院哈尔滨兽医研究所; 华南农业大学; 兽医生物技术国家重点实验室; 广东温氏食品集团股份有限公司