基于生物信息分析筛选甲状腺乳头状癌致病风险基因

作者：张芝; 任医群; 牛彦强; 杨大雄; 任建伟; 周祖邦^*

来源：兰州大学学报(自然科学版), 2022, 58(06): 847-852.

DOI：10.13885/j.issn.0455-2059.2022.06.019

• 甲状腺乳头状癌
• 生物信息学分析
• 关键基因
• 生物标志物

从基因表达总数据库中下载4组甲状腺乳头状癌基因芯片数据集,利用GEO2R软件筛选出164个差异性表达基因(DEGs),通过Metascape和STRING软件对DEGs进行生物学功能分析和蛋白质互作网络图构建.富集分析显示DEGs与癌症中的细胞外基质-受体、蛋白质的消化吸收以及MAPK信号传导途径等有密切关系.利用Cytoscape软件筛选出13个关键基因,采用GEPIA、UALCAN等数据库对关键基因进行双重验证及生存分析后,发现COMP和APOE影响总体生产率,TIMP1、LGALS3、KAT19、APOE可能与甲状腺肿瘤细胞的淋巴结转移相关,提示这些基因可能成为预后分子生物标志物和潜在的靶向基因治疗目标.

• 单位
  甘肃省人民医院; 第一临床医学院; 甘肃中医药大学