神经源性高血压小鼠差异靶基因分析——基于GEO数据库数据挖掘

作者：刘镍; 苏文渊; 覃辉; 何博; 胥勇; 刘信; 罗晓舟; 唐纯志; 罗伦^*

来源：中国老年学杂志, 2020, 40(22): 4835-4838.

• 神经源性高血压
• 生物信息学
• 差异基因
• GEO数据库
• 基因芯片

目的通过分析GSE25076基因芯片数据,探索神经源性高血压小鼠下丘脑的差异基因,尝试寻找该病的潜在治疗靶点。方法在NCBI提供的GEO2R平台内检索GSE25076,将全部数据下载保存为Excel格式,并进行差异基因分析。采用DAVID平台进行GO分析,京都基因与基因组百科全书(KEGG)平台进行KEGG通路分析,STRING平台进行基因互作(PPI)分析。结果在GEO2R平台内对神经源性高血压小鼠芯片数据进行分析,共获得34 760个差异基因,最终获得28个符合条件的基因。这28个差异基因富集在磷脂分解代谢过程、水解酶活性调节等过程。KEGG分析表明其富集于RNA转运通路。结论真核翻译起始因子(EIF)4A3和核糖核酸酶(POP4)最为可能是神经源性高血压发生的基因层面的原因,通过RNA转运通路,影响神经发育、血管生成及神经发生等过程,最终导致本病的发生发展。

• 单位
  广州中医药大学; 成都市第二人民医院