基于细胞色素B(Cyt b)基因对翘嘴鲌不同群体遗传多样性的分析

作者：张桂宁; 方弟安^*; 薛向平; 张敏莹; 冯晓婷; 杨雪军

来源：中国农学通报, 2021, 37(23): 118-124.

• 翘嘴鲌
• 线粒体DNA
• 细胞色素b基因
• 遗传多样性

为了解长江下游翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)不同群体遗传多样性水平,评估其资源状况。研究以淀山湖(DSH)、太湖(TH)、长荡湖(CD)和长江(CJ)4个水域共211尾翘嘴鲌为研究对象,对其线粒体DNA细胞色素b基因(Cyt b)序列进行测序分析,所得基因序列在NCBI中比对,运用MEGA、DNASP等软件分析得到4个翘嘴鲌群体的遗传多样性数据。翘嘴鲌Cyt b基因序列长度为1088 bp,其中碱基A+T含量为55%,G+C为45%。共检测到258个多态位点,占核苷酸总数的23.71%。4个群体211个样本中得到46个单倍型,单倍型多样性为0.849～0.946,具体表现为TH>CD>CJ>DSH。核苷酸多样性为0.0083～0.174,具体表现为DSH> CD>CJ>DSH。4个群体间遗传距离0.052～0.152,太湖群体和淀山湖群体的群体间遗传距离最大为0.152。群体间的遗传分化指数范围为0.197～0.646,基因流值范围为0.152～1.019,其中长江与淀山湖群体的基因流值最小,长江与长荡湖群体的基因流值最大。基于NJ法构建的系统进化树结果显示,4个群体翘嘴鲌没有明显地理区分。本研究结果表明,长江下游翘嘴鲌群体遗传多样性较高,结合近年来翘嘴鲌渔业资源的调查结果,以深入了解其遗传背景和种质资源现状,为翘嘴鲌的野生资源保护提供基础数据。

• 单位
  中国水产科学研究院淡水渔业研究中心; 上海海洋大学