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摘要
目的：分析西洋参（Panax quinquefolium）根部内生微生物的群落结构，寻找西洋参根部内生真菌和内生细菌的优势菌属，为建立西洋参根部内生微生物库奠定基础。方法：采用PacBio SequelⅡ测序平台，对采自山东文登的6株西洋参根部组织进行内转录间隔区（ITS）和16S测序。结果：西洋参根部内生细菌共鉴定到8门、11纲、23目、27科、53属，其中优势菌属为一种伯克氏菌（unidentified Burkholderiaceae）和一种根瘤菌（unidentified Rhizobiaceae）等。西洋参根部内生真菌共鉴定到9门、23纲、35目、43科、48属，其中优势菌属为一种柔膜菌（unclassified Helotiales）和假裸囊菌属（Pseudogymnoascus）等。根部内生细菌群落结构显示，一种根瘤菌（unidentified Rhizobiaceae）、慢生根瘤菌属（Bradyrhizobium）和草螺菌属（Herbaspirillum）等固氮菌在西洋参根部具有较高的相对丰度，暗示氮元素对西洋参根系生长发育的重要性。根部内生真菌群落结构显示，山东地区西洋参可能受到柔膜菌目真菌侵染的威胁。结论：西洋参根部内生细菌和真菌具有丰富的多样性，为进一步研究西洋参根与内生微生物的互作、筛选促进西洋参根系生长的内生细菌和内生真菌提供科学依据。
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单位中国中医科学院; 江苏大学
