链霉菌新物种Streptomyces wensuensis TRM68367全基因组测序及生物信息学分析

作者：曹然; 罗晓霞; 张利莉^*

来源：塔里木大学学报, 2021, 33(03): 1-9.

• 温宿链霉菌
• 全基因组测序
• 生物信息学

Streptomyces wensuensis TRM68367是一株分离自新疆阿克苏温宿县台兰河淤泥的链霉菌新物种,对其进行活性筛选发现该菌株对蜡状芽孢杆菌具有抑菌活性。本研究采用Illumina Hiseq 2000测序平台对菌株Streptomyces wensuensis TRM68367进行全基因组测序及生物信息学分析,发现TRM68367基因组大小为8 297 736 bp,GC含量为71.43%,预测到9 186个基因组开放读框(ORFs);通过对次级代谢产物进行预测分析,共预测到33个潜在次级代谢生物合成基因簇,结果表明TRM68367具有较强的产次级代谢产物的潜力,为深度挖掘次级代谢产物奠定了理论基础。

• 单位
  塔里木大学; 生命科学学院