乙型肝炎病毒稳定转染后宿主细胞高级染色质结构改变分析

作者：江修宇; 郝晓娟; 周喆; ***; 杨骞^*

来源：军事医学, 2023, 47(09): 662-667.

• 乙型肝炎病毒
• HepG2细胞
• 肝细胞癌
• 三维基因组
• 染色质易位
• 拓扑相关结构域

目的 研究乙型肝炎病毒（HBV）对肝细胞三维基因组学空间组织结构的影响。方法 使用桥接高通量染色质构象捕获（BL‐Hi‐C）技术，获取HBV稳定转染细胞HepG2.CW与对照细胞HepG2的基因组三维空间互作信息，并联合转录组测序分析差异表达基因。通过CCK‐8实验及Kaplan‐Meier生存分析方法分别检测细胞増殖活力，分析差异表达基因功能。结果 BL‐Hi‐C实验获取了2株细胞的基因组三维互作信息，在50 kb分辨率下，HBV稳定转染细胞HepG2.CW与HepG2相比，16号染色体与22号染色体发生了染色体易位以及易位点染色体拓扑相关结构域（TAD）的融合变异。结合转录组数据发现，染色体易位点及TAD变异关联区域的22号染色体开放阅读框34(C22ORF34）与肌醇加氧酶（MIOX）出现明显变化。细胞生长曲线表明，HepG2.CW具有更高的细胞増殖活力。生存分析发现C22ORF34及MIOX基因与患者的生存预期密切相关。结论 HBV稳定转染可引起HepG2细胞发生染色体易位及三维基因组结构改变，并导致相关区域内C22ORF34和MIOX基因的表达改变。