牦牛MEF2C基因克隆、生物信息学及表达谱分析

作者：王兴东; 吴晓云; 郭宪; 马进寿; 殷满才; 阎萍^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(04): 1505-1512.

DOI：10.13417/j.gab.040.001505

• MEF2C
• RT-qPCR
• 大通牦牛
• 生物信息学分析

本试验旨在分析牦牛(Bos grunniens)肌细胞增强因子2C (myocyte enhancer factor 2C, MEF2C)基因的分子特征和表达规律,探索其影响牦牛肌肉发育的作用机制。试验以大通牦牛肌肉组织cDNA为模板,采用PCR扩增技术扩增牦牛MEF2C基因,用DNAStar,ExPASy,ABCpred等生物信息学软件分析MEF2C基因序列和其编码的蛋白质结构,利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测了MEF2C基因的表达情况。试验克隆获得的牦牛MEF2C基因编码区全长1 302 bp,编码433个氨基酸;蛋白质结构预测结果显示,MEF2C蛋白具有30 h的半衰期,为亲水性碱性蛋白,没有信号肽但拥有跨膜结构。系统关系中牦牛与普通牛的亲缘关系最为接近,与小鼠亲缘关系较远。组织表达谱结果显示,MEF2C基因在牦牛7个组织中都有表达且在臀二头肌组织中表达量最高;不同时期MEF2C基因表达情况为胎牛>成年牛>6月龄牛。研究结果将为进一步探讨MEF2C基因在牦牛肌肉发育中的作用提供科学依据,同时也为解析牦牛肌肉发育的分子机制提供数据支撑。

• 单位
  中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所; 青海省大通种牛场; 西北民族大学