牛NTM基因可变剪接体和印记状态分析

作者：徐达; 李俊良; 张萃; 陈玮娜; 李冬杰; 李世杰^*

来源：农业生物技术学报, 2018, 26(10): 1707-1713.

• 牛
• Neurotrimin基因(NTM)
• 剪接体
• 印记状态
• 单核苷酸多态性(SNP)

NTM (neurotrimin)在神经发育中具有重要作用,在人类(Homo sapiens)相关研究中是印记基因,但是在牛(Bos taurus)中的印记状态尚未揭示。本研究旨在分析牛NTM基因的序列特征和编码蛋白结构,并鉴定NTM基因在成年牛组织和胎盘中的印记状态。本研究首先应用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends, RACE),得到1个牛NTM基因新的剪接体NTMxd (GenBank No.:MH037574),通过对其编码氨基酸序列进行分析,发现其N端具有完整的跨膜信号。为了分析NTM基因在牛中的印记状态,首先通过PCR产物直接测序法在牛NTM基因上发现1个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,GenBank登录号为rs42185569;然后提取杂合子牛胎盘和组织样本RNA,并进行反转录PCR (reverse transcription-PCR, RT-PCR)。对扩增产物直接测序发现,NTM基因在牛胎盘中和成年牛组织中均为单等位基因表达。本研究结果表明NTM基因在牛中是印记基因,为深入研究NTM基因的功能和相关神经发育疾病提供了参考依据。

• 单位
  河北科技大学; 河北农业大学; 河北大学; 生命科学学院