毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的克隆及序列分析

作者：张艳; 高健; 徐有明

来源：分子植物育种, 2010, 08(3): 533-541.

DOI：10.3969/mpb.008.000533

• 毛竹
• β-1
• 3-葡聚糖酶基因
• 基因克隆
• 序列分析
• 表达载体

β-1,3-葡聚糖酶是一种植物病程相关蛋白,在植物抵御病害中有重要作用.本研究以毛竹为实验材料,利用RACE技术,克隆毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的外显子序列,并在β-1,3-葡聚糖酶基因的编码区两端设计引物,以毛竹基因组DNA为模版扩增该基因的内含子序列.序列结果表明,该基因全长1 693 bp,包含两个外显子和一个内含子,命名为PheGLU(GenBank登录号GU238236).该基因包含1个996 bp的开放阅读框,编码332个氨基酸,相对分子质量为3.541x104Da,其等电点pI为6.389,是一个酸性蛋白且分泌到胞外;其中,该蛋白的二级结构中包含35.15%的α-螺旋,21.82%的α-转角,43.03%的延伸链和无规则卷曲等;三级结构同源建模预测显示,它与大麦β-1,3一葡聚糖酶(PDB number:lghsA)具有80.4%的同源性;聚类分析显示,该基因序列与已报道的其它植物具有较的高氨基酸序列同源性.本研究为进一步鉴定毛竹β-1,3-葡聚糖酶基因的抗真菌病害能力奠定了基础.

• 单位
  国际竹藤中心; 华中农业大学; 国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室