2018—2019年漳州市诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征

作者：郭丽清; 许美燕; 林淑银; 陈秋虾; 杨彬彬; 陈锦钟; 蔡茂荣^*

来源：国际病毒学杂志, 2020, 27(05).

• 胃肠炎
• 暴发疫情
• 诺如病毒
• 基因型
• 系统进化树

目的分析2018—2019年漳州市诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征。方法选取2018年2月至2019年10月漳州市16起聚集性胃肠炎疫情中的114例疑似病例作为研究对象。收集研究对象粪便、带便肛拭子或呕吐物标本, 采用荧光定量PCR方法对标本进行诺如病毒基因检测, GⅡ组阳性样本进一步用普通RT-PCR方法对部分聚合酶区(RdRp)-衣壳区(VP1)进行基因扩增, 阳性标本进行测序并做系统进化分析。结果 16起聚集性胃肠炎疫情中, 11起诺如病毒检测阳性。114例疑似病例中, 实验室确诊55例, 阳性率为48.25%。其中, GⅡ组48例, GI组1例, GI组和GⅡ组同时阳性的6例;男性40例(72.73%, 40/55),女性15例(27.27%, 15/55);14岁以下儿童43例, 占78.18%(43/55);幼儿园及中小学为主要暴发场所(9/11);季节高峰主要在2—3月及9—12月(10/11)。测序共获得来自8起聚集性疫情中的27份标本序列, 系统发育树构建结果显示有4种GⅡ组基因型, 包括15株GⅡ.2[P16]、2株GⅡ.4Sydney[P31]、4株GⅡ.17[P17]和6株GⅡ.3[P12]。结论诺如病毒是引起漳州市聚集性胃肠炎的常见病原体, 其中GⅡ.2[P16]变异株为本地区优势流行株。