1株境外输入性新冠病毒奥密克戎BQ.1.1全基因组测序及特征分析

作者：史燕; 努尔艾孜孜·努尔麦麦提; 杨国平; 田锋; 张金龙; 胡双双; 聂国嫒; 苏小建; 杨庆贵; 耿合员^*

来源：中国国境卫生检疫杂志, 2023, 46(02): 106-109.

DOI：10.16408/j.1004-9770.2023.02.002

• 新冠病毒
• 输入性
• 全基因组
• 奥密克戎变异株

目的 针对1例境外输入性新冠病毒感染者咽拭子样本开展全基因组测序，掌握输入性新冠病毒基因组特征，为口岸新冠肺炎疫情防控提供科学依据。方法 对1例从江苏口岸入境的输入性新冠病毒感染者的咽拭子样本，用二代测序技术进行全基因组测序，并通过生物信息学软件进行序列分析并构建进化树。结果 获得1株输入性新冠病毒全基因组序列（GenBank No. OP804248），基因组全长29 762 bp，基因分型结果显示为奥密克戎BQ.1.1型。与原始毒株（GenBank No. NC＿045512.2）相比，该毒株共有78个碱基发生了突变，59个区域发生了缺失；氨基酸突变有62个，氨基酸缺失14个。结论 奥密克戎BQ.1.1型为江苏口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型，为当地口岸新冠病毒的溯源及防控提供重要科学依据。

• 单位
  江苏国际旅行卫生保健中心; 新疆国际旅行卫生保健中心