小儿特发性扩张型心肌病核心基因鉴定和免疫浸润分析

作者：尤红俊; 赵倩倩; 苟棋玲; 董梦雅^*

来源：中西医结合心脑血管病杂志, 2023, 21(20): 3703-3710.

• 扩张型心肌病
• 差异表达基因
• 生物信息学
• 核心基因
• 免疫浸润

目的:利用生物信息学分析筛选小儿特发性扩张型心肌病(PIDC)的核心基因，并进行免疫浸润分析。方法:使用R语言对来自基因表达综合数据库(GEO)的PIDC转录谱进行差异分析。利用R语言对差异表达基因(DEGs)进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过STRING数据库和CytoHubba构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络及鉴定核心基因。利用比较毒理基因组学数据库(CTD)分析核心基因与心肌病、心力衰竭风险的关系。利用单样本基因集富集分析(ssGSEA)计算PIDC中28种免疫细胞在免疫浸润微环境中的比例。结果:PIDC左心室有137个DEGs,主要参与对外部刺激的正向调节、炎症反应的调节、中性粒细胞的激活和介导的免疫、细胞-基质黏附的正向调节、细胞外结构、含胶原的细胞外基质等。DEGs参与细胞凋亡、胰岛素抵抗、花生四烯酸代谢和缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。鉴定的核心基因为信号转导和转录激活因子3(STAT3)、CD68、高亲和力IgE受体γ亚基基因(FCER1G)、细胞周期素D1(CCND1)和CD163,其与心肌病、心力衰竭关联紧密。PIDC左心室组织中央记忆型CD8+T细胞的含量较高；活化的树突样细胞、骨髓来源的抑制性细胞、自然杀伤T细胞、浆细胞样树突状细胞、滤泡辅助性T细胞的含量较低。结论:炎症及免疫反应在PIDC的发病机制中发挥着重要作用，5个核心基因和6种免疫细胞与PIDC发生发展密切相关。

• 单位
  中国人民解放军空军军医大学; 陕西省人民医院