狗枣猕猴桃锌指蛋白（AkCHY）的生物信息学分析

作者：陈鑫; 李然红; 刘丹; 王立凤; 刘思言

来源：贵州农业科学, 2019, 47(09): 106-109.

• 狗枣猕猴桃
• AkCHY
• 生物信息学

为研究狗枣猕猴桃锌指蛋白(AkCHY)功能提供参考,利用生物信息学工具和方法,对其蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明:AkCHY的cDNA全长为1 768bp,编码区(CDS)为837bp,是由279个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于ZF-CHY和zinc-ribbon-6蛋白家族成员(ID:11342810),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,包含锌指结构特有的RING型结构域;与其他15种植物的CHY氨基酸序列进行对比,狗枣猕猴桃与中华猕猴桃原变种的亲缘关系较近。

• 单位
  牡丹江师范学院