中国龙虾Pan s 1抗原表位研究及相关虾蟹类蛋白进化分析

作者：黄于艺; 陈惠芳; 何颖; 邹泽红; 陶爱林

来源：现代仪器与医疗, 2013, (01): 1-4.

• 中国龙虾
• Pan s 1
• 抗原表位
• 进化分析 Panulirus stimpsoni Pan s 1 Epitopes The evolutionary analysis

在Uniprot数据库中获得中国龙虾过敏原Pan s 1蛋白序列,使用DNAStar和NetMHCⅡ分别预测B细胞和T细胞表位,并对其进行抗原性评分;使用Swiss-Model软件生成其三维结构,并利用Ramachandran plot分析进行模型有效性评估。在Uniprot数据库搜集不同种类的虾蟹原肌球蛋白序列,利用MEGA5.1用JTT G模型构建ML(Maximum Likelihood)进化树。结果显示,中国龙虾过敏原Pan s 1三维结构为2条相互缠绕的α-螺旋。Pan s 1的B/T细胞共有抗原表位区域为81～95,146～157。同体型大小的虾蟹类之间,可能更为容易产生种群间的交...

• 单位
  广州医科大学; 呼吸疾病国家重点实验室