水稻OsEnS51可变剪接及编码蛋白结构分析

作者：符霖; 王慧慧; 黄思琳; 阎新; 王鑫

来源：分子植物育种, 2021, 1-9.

• 水稻
• 种子特异表达基因
• 可变剪接
• 表达分析
• 蛋白质三维结构

本研究综合运用生物信息学、RT-PCR和TA克隆技术对水稻胚乳特异表达基因OsEnS51的可变剪接本进行鉴定，并分析剪接本的表达模式和蛋白质结构。首先，利用生物信息学分析发现，该基因可能存在4种可变剪接转录本。结构域分析发现，OsEnS51.1和OsEnS51.2含有2个Cupin＿1结构域，而OsEnS51.3和OsEnS51.4仅含有1个Cupin＿1结构域，表明OsEnS51不同可变剪接本所表达的蛋白存在结构分化。根据不同可变剪接本的序列信息设计特异性引物，进行RT-PCR扩增，结合TA克隆和测序成功鉴定到其中3种可变剪接转录本，分别是OsEnS51.1、OsEnS51.3和OsEnS51.4。表达分析结果显示OsEnS51.1234在授粉后7～15天的种子表达较高，且随着种子的发育其表达不断增加；另外OsEnS51.4的表达量比OsEnS51.1高，表明OsEnS51不同可变剪接本的含量存在差异。综上，OsEnS51至少存在3种不同可变剪接本，且编码的蛋白存在结构分化，为进一步研究OsEnS51的生物学功能提供了基础。

• 单位
  江西省分子生物学与基因工程重点实验室; 南昌大学; 生命科学学院