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摘要
表面等离子共振成像(SPRI)是一种高灵敏度,高通量的,可用于实时分析生物蛋白间的相互作用的新技术。由于高通量,不需要额外标记等优点,该技术广泛应用于药物筛选、食品检测、环境监测等领域。实现SPRI视频自动化分析的关键是自动定位SPRI视频图像中的蛋白阵列,为解决该问题提出了基于重映射的SPRI视频自动找点的算法。算法需要输入生物芯片的打印效果图和SPRI视频图像,处理过程分为六个部分:截取,边缘检测,椭圆拟合,阵列识别,坐标映射和自动校准,输出SPRI视频中蛋白点阵列的坐标矩阵。算法基于将打印效果图中的蛋白点坐标重映射为SPRI视频中蛋白点坐标思路实现。实验结果表明,该算法能准确定位SPRI视频中的蛋白阵列,不受蛋白点的阵列模式和SPRI视频中噪音的影响。并且算法定位SPRI视频中蛋白阵列耗时短,支持在嵌入式设备上实时分析SPRI视频。
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