基于线粒体编码核糖体基因的海蛇DNA条形码筛选

作者:王湘君; 陈文*; 苏海英; 杜宇; 林炽贤
来源:基因组学与应用生物学, 2020, 39(07): 3008-3016.
DOI:10.13417/j.gab.039.003008

摘要

海蛇是名贵中药材,也是滋补佳品,分子鉴定方法可适用于海蛇组织。为筛选适合海蛇DNA条形码的基因,本研究搜索并下载了GenBank上所有12S和16S基因序列。其中每个物种每个基因,尽量保留所有序列,但最多保留不同来源的5条序列。运用Mega软件比对后,建立MrBayes系统聚类树。结果显示,相对12S基因,16S基因序列包含物种多;其MrBayes树拓扑结构清晰,支持率高,适合作为DNA条形码。因此得出结论,不是每类物种的DNA条形码都必须是COI基因,对于海蛇的线粒体编码核糖体基因,16S适合度更高。筛选DNA条形码基因,可通过蛇肉、蛇皮、蛇胆、蛇血等组织,测得DNA序列片段,从而鉴定物种;可用于海关、餐饮、中药、环保等部门,从而保护野生动物,打击走私犯罪。

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