SARS-CoV-2病毒全基因组序列比对及进化分析

作者：周翔; 赵仁生; 崔艺璇; 许诗嘉; 宋鹏飞; 温敏; 袁燕; 万春平

来源：云南民族大学学报(自然科学版), 2022, 31(02): 176-185.

DOI：10.3969/j.issn.1672-8513.2022.02.007

• 多序列比对
• SARS-CoV-2
• 同源性

SARS-CoV-2病毒株是β属冠状病毒，它包括S、N、E、M 4个主要编码蛋白，是造成中国湖北省武汉市爆发重大公共卫生事件的罪魁祸首，目前对该病毒的系统性研究分析并不是很多.运用计算机辅助软件工具来对筛选自NCBI基因文库中的36条来自不同国家地区的SARS-CoV-2病毒株序列进行全序列比对分析，从而找出SARS-CoV-2病毒株可能存在的易变异区域，以及对所有序列的同源性及亲缘性进行分析，找出其传播径途及区域进化特点.通过对不同地区的SARS-CoV-2病毒株序列比对分析发现，SARS-CoV-2病毒株的ORF1ab蛋白编码区及S蛋白编码区存在高度变异性，为SARS-CoV-2病毒疫苗及相关药物的研制提供了相关参考.随后结合进化树和同源性进行分析发现，流行于美国等地区的SARS-CoV-2病毒与中国武汉发现的SARS-CoV-2病毒虽然有着相同的祖先，但其进化分支却是不同的，为SARS-CoV-2病毒的追根溯源提供了相关依据.

• 单位
  云南中医药大学; 医药学院; 云南民族大学