茄子PARMS反应体系的建立与优化

作者：肖熙鸥^*; 赵秋芳; 林文秋; 欧雄常; 冯恩友; 莫定鸣

来源：分子植物育种, 2021, 19(18): 6074-6079.

DOI：10.13271/j.mpb.019.006074

• 茄子
• SNP
• PARMS
• 反应体系优化

本研究基于茄子自交系WT和L6-5重测序数据设计SNP特异引物,通过对反应体积、DNA用量和引物浓度等参数进行优化,建立了茄子PARMS (Penta-primer amplification re-fractory mutation system) SNP分型体系。研究结果表明最佳反应体系为6μL,其中1μL DNA模板(10～100 ng/μL),3μL PARMS mix (2×),0.45μL引物混合物(100μmol/L),1.55μL ddH2O。利用WT和L6-5的F2群体验证该体系的稳定性,获得了较好的SNP分型结果。本研究建立的PARMS-SNP分型体系,为开展茄子种质资源遗传多样性分析、基因定位、指纹图谱构建和分子标记辅助选择等提供了技术支持。

• 单位
  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所; 湛江市农业科学研究院