生物信息学分析CA3在乳腺癌组织中的表达和对预后的影响

作者：张江涛; 阮晖朝; 吴向华

来源：中国普外基础与临床杂志, 2021, 1-8.

• 乳腺癌
• 碳酸酐酶3
• 预后
• 免疫浸润
• 生物信息学

目的 通过多种在线数据库分析碳酸酐酶3（carbonic anhydrase 3,CA3）在乳腺癌的表达差异，预后潜力以及相关机制。方法 使用GEPIA2.0和TIMER数据库资料分析CA3 mRNA在乳腺癌组织中的表达差异；使用Bc-GenExMinerv4.6数据库资料分析乳腺癌亚分类的CA3 mRNA的表达差异；使用Kaplan-Meier绘图仪、Bc-GenExMinerv 4.6和PrognoScan数据库资料分析CA3 mRNA表达水平与乳腺癌患者预后的关系；使用LinkedOmics数据库资料分析CA3共表达基因及其生物学行为；使用TIMER数据库资料分析乳腺癌组织中CA3mRNA的表达与免疫细胞浸润的关系。结果 乳腺癌组织中CA3 mRNA表达水平低于正常乳腺组织（P<0.05），在ER阴性（P<0.01）、PR阴性（P<0.05）、HER-2阴性（P<0.001）以及无淋巴转移者（P<0.01）其表达水平较高，且CA3 mRNA的表达与Ki67的表达成反比关系（P<0.01），与SBR和NPI分级具有相关性（P<0.001）;CA3 mRNA表达水平低的乳腺癌患者其OS、RFS和DFS均较低（P<0.05）；筛选出的50个共表达基因中有22个基因与患者的预后有关；在乳腺癌组织中CA3 mRNA表达与CD4+T细胞和CD8+T细胞具有正相关关系（r=0.175,P<0.001;r=0.137,P<0.001），与T细胞衰竭标志物LAG3、TIM-3和PVRL2呈负相关关系（r=–0.1,P<0.01;r=–0.143,P<0.001;r=–0.082,P<0.05）。结论 CA3 mRNA在乳腺癌组织中的低表达与乳腺癌的发生发展及预后存在一定的相关性，可以作为乳腺癌预后潜在标志物，可能与免疫浸润有关。

• 单位
  广西医科大学第一附属医院