189份桃种质肉质性状形成相关位点基因型鉴定及组合分析

作者：王朝晖; 李勇; 曹珂; 朱更瑞; 方伟超; 陈昌文; 王新卫; 吴金龙^*; 王力荣^*

来源：中国农业科学, 2023, 56(12): 2367-2379.

• 桃
• 肉质
• 基因型鉴定
• 基因型组合

【目的】通过分子标记与生物信息学手段，鉴定189份桃种质与肉质形成相关的F-M基因座、YUC11启动子区转座子插入、NAC72编码区9 bp插入的基因型及3个位点组合情况，为深入研究桃果实肉质形成机制及育种亲本选配提供理论基础。【方法】通过PCR扩增、竞争性等位基因特异PCR(kompetitive allele specific PCR,KASP)、高分辨率溶解曲线（high resolution melting analysis,HRM）技术，对F-M基因座倍型、YUC11转座子插入、NAC72 9 bp插入进行检测；同时结合重测序数据利用生物信息学方法进一步验证，从而准确鉴定189份桃种质肉质性状形成相关位点基因型及组合情况。【结果】F-M基因座编码多聚半乳糖醛酸酶（endo-PG）的PGM与PGF是调控桃果实肉质形成的两个重要基因。189份桃种质中，PGM与PGF分别有159份（84%）、99份（52%）。F-M基因座共发现H0、H1、H2、H3 4种单倍型，占比分别为33%、39%、4%、24%。在F-M基因座，不溶质粘核以H3H3、H2H3组合为主，溶质粘核以H0H0、H0H1组合为主，溶质离核以H1H1、H0H1组合为主。发现18份含有硬质基因型的种质，在YUC11启动子区含有转座子纯合插入。HRM结果表明，NAC72编码区9 bp插入纯合（早熟）有45份种质、插入杂合（中熟）有71份种质、无插入（晚熟）有73份种质，中熟与晚熟种质占比77%；其中6份种质基因型与表型差别较大。不溶质粘核、溶质粘核、溶质离核3种常见肉质类型，在3个位点最多的基因型组合分别是mmffHdHdI、MMffHdHdI、MMFFHdHdL。【结论】通过分子试验与生物信息学相结合进一步证实了F-M基因座存在4种单倍型；发现18份含有硬质基因型的种质；开发了一种用于鉴定桃成熟期的分子标记；鉴定出不同种质在肉质相关位点的基因型组合形式。

• 单位
  中国农业科学院郑州果树研究所