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摘要
目的获得虎乳灵芝菌丝体、菌核初期、菌核后期转录组数据,分析其菌核形成机制及重要化合物合成的相关基因。方法利用Illumina高通量测序技术对虎乳灵芝样品进行转录组测序,通过从头组装获得Unigene,利用nr、SwissProt、KEGG、COG/KOG数据库对Unigene进行注释和分类,分析发育过程的差异基因,并对共有的差异基因进行趋势分析。结果 3个阶段9个虎乳灵芝样品共获得12210条unigene序列,通过与数据库比对确定功能的unigene共有7997条,占全部序列的65.50%。菌丝体阶段至菌核后期阶段所共有的差异基因有559条,主要被富集到β-丙氨酸代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢、MAPK信号通路等代谢途径。结论根据差异基因的通路富集注释结果和相关报道,推测虎乳灵芝菌核形成的原因主要是由氧化应激导致,同时伴随着细胞壁的增厚、多糖和蛋白质的合成等过程。qPCR验证结果显示,所选基因表达趋势与转录组测序结果一致。
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