本发明公开了一种硫磺基自养微生物脱氮材料及其制备和应用方法,该自养脱氮材料是将含硫磺的原料与石灰粉混合后,经熔融、成型、表面碳酸化而获得的颗粒物。本发明的自养脱氮材料作为厌氧生物滤池的填料构建深层厌氧生物滤床,在适宜的温度下、水力停留时间40~60min可以使25mg/L硝酸盐和亚硝酸盐氮降低到5mg/L以下,本发明的材料替代乙酸钠等有机物碳源反硝化脱氮,节约脱氮成本50%以上。